日本财政部：日本制订财政和货币政策的唯一部门。日本财政部对货币的影响要超过美国，英国或德国财政部。日本财政部的官员经常就经济状况发布一些言论，这些言论一般都会给日元造成影响，如当日元发生不符合基本面的升值或贬值时，财政部官员就会进行的口头干预。
日本央行：在1998年，日本政府通过一项新法律，允许央行可以不受政府影响而独立制订货币政策，而日元汇率仍然由财政部负责。
利率：隔夜拆借利率是主要的短期银行间利率，由BOJ决定。BOJ也使用此利率来表达货币政策的变化，是影响日元汇率的主要因素之一。
日本政府债券：为了增强货币系统的流动性，BOJ每月都会购买10年或20年期的JGBs。10年期JGB的收益率被看作是长期利率的基准指标。例如，10年期JGB和10年期美国国库券的基差被看作推动美元/日元利率走向的因素之一。JGB价格下跌(即收益率上升)通常会利好日元。
经济和财政政策署：该部门于2001年1月6日正式替代原有的经济计划署(Economic Planning Agency，EPA)。职责包括阐述经济计划和协调经济政策，包括就业，国际贸易和外汇汇率。